中国动物卫生与流行病学中心（以下简称中心）是农业农村部直属正局级事业单位，是承担重大动物疫病调查、诊断、监测，动物和动物产品兽医卫生评估，动物卫生法规标准和重大外来动物疫病防控技术措施研究等工作的国家级动物卫生机构。中心2006年由前“农业部动物检疫所”更名而来，总部位于青岛市北区，拥有青岛红岛、宁波中央山岛2个创新实验基地，正在胶州上合示范区建设胶州创新基地，投资青岛易邦生物工程有限公司、青岛立见生物科技有限公司两个高新技术企业。中国农业科学院北京、哈尔滨、兰州、上海四个兽医研究所加挂分中心牌子。
根据2006年4月8日农业部办公厅关于中国动物卫生与流行病学中心主要职责、内设机构和人员编制的批复（农办人〔2006〕40号），中心主要职责为：
（一）负责组织开展动物流行病学调查、分析、研究和疫病普查；负责收集、处理、保藏各种动物血清，开展重大动物疫病动态监测和疫情追溯。
（二）负责重大外来动物疫病诊断、疫情监测及防控技术措施研究。
（三）负责收集国外动物疫情信息，建立国家动物卫生与流行病学数据库，开展动物疫病预警分析工作。
（四）承担动物和动物产品兽医卫生评估、动物疫病区域风险评估工作，组织实施企业动物卫生认证。
（五）协调国家动物卫生与流行病学分中心、国家兽医参考实验室、各级各类兽医实验室和流行病学调查工作，分析和汇总流行病学调查相关数据，提出流行病学调查总体报告。
（六）开展动物疫病诊断技术和诊断试剂研究。
（七）收集分析国际动物卫生法律法规和SPS协议相关法规及案例，开展动物卫生法规标准研究工作；承担动物卫生技术贸易措施及国际兽医事务的综合评估工作。
（八）承担全国动物防疫标准化技术委员会和全国动物卫生流行病学专家委员会的日常工作。
（九）完成农业农村部交办的其他任务。
